Kościół został założony w 1689 r. przez profesorów uniwersytetu Jagiellońskiego. Uważany jest za jedną z najpiękniejszych barokowych budowli w Polsce. Warto zwrócić uwagę na fasadę utworzoną przez zachodzenie trzech portali jeden w drugi. Wewnątrz znajdziemy wspaniałe zdobienia stiukowe dzieła Baldassare Fontany (nawa i ołtarz). W prawym transepcie zauważyć można sarkofag z relikwiami świętego Jana Kantego (1390-1473) podtrzymywany przez cztery alegoryczne postacie będące symbolami głównych wówczas fakultetów uniwersytetu (filozofia, teologia, medycyna i prawo).